Da ich gerade mal wieder dabei bin meine Hardware auf den neusten Stand zu bringen, die wenigsten flash tools jedoch bereits für Windows 2008 und schon drei Mal nicht für eine x64 Edition vorbereitet sind, bastle ich mir zur Zeit eine neue Windows 2003 R2 PE CD / Pendriver. Die folgenden beiden Artikel haben sich dabei als sehr gute Hilfestellung erwiesen:

Walkthrough: Create a Custom Windows PE Image

Windows PE Customization How-To Topics